农产品增值税进项税额核定扣除是指为加强农产品增值税进项税额抵扣管理，试点纳税人购进农产品不再凭增值税扣税凭证抵扣增值税进项税额，而是采用一定的进项税额核定办法来进行抵扣。本文以安徽为例对农产品核定扣除政策进行梳理。

  根据《财政部 国家税务总局关于在部分行业试行农产品增值税进项税额核定扣除办法的通知》（财税〔2012〕38号）规定，自2012年7月1日起，以购进农产品为原料生产销售液体乳及乳制品、酒及酒精、植物油的增值税一般纳税人，纳入农产品增值税进项税额核定扣除试点范围，其购进农产品无论是不是用来生产上述产品，增值税进项税额均按照《农产品增值税进项税额核定扣除试点实施办法》的规定抵扣。

  根据《财政部国家税务总局关于扩大农产品增值税进项税额核定扣除试点行业范围的通知》（财税〔2013〕57号）规定，2013年9月1日起，相关权限下放至省一级。以安徽为例，到目前为止，实行农产品核定扣除政策的试点行业包括：皮棉、棉纱、精制茶、瓜子、面粉、大米、中药饮片、胶合板芯板、胶合板、一水柠檬酸、无水柠檬酸、蚕丝绸、宣纸、生物质燃料、年糕加工等行业、中药材商品交易、羽绒制品加工、豆制品加工、淀粉、肠衣（含肝素钠）、竹地板、竹胶板。详见下表：

  国家税务总局安徽省税务局 安徽省财政厅关于扩大农产品增值税进项税额核定扣除试点相关事项的公告（国家税务总局安徽省税务局公告2021年第8号）

  目前大部分地区使用投入产出法核定农产品增值税进项税额，成本法在逐步被淘汰。纳税人购进农产品根据主要用途不同可分为以下三类，核定方法如下：

  当期允许抵扣农产品增值税进项税额=当期农产品耗用数量×农产品平均购买单价×扣除率/（1＋扣除率）

  当期农产品耗用数量=当期销售货物数量（不含采购除农产品以外的半成品生产的货物数量）×农产品单耗数量

  注：农产品是指列入《农业产品征税范围注释》（财税字〔1995〕52号）的初级农业产品，扣除率为销售货物的适用税率，下同。目的是为了体现增值税对增值额征税的特点，使得最终产品销项计算税率和它的原料的进项计算税率相一致。

  案例一：某公司2019年5月1日—5月31日销售10000吨巴士杀菌羊乳，其主营业务成本为6000万元，农产品耗用率为70%，原乳单耗数量为1.06，原乳平均购买单价为4000元/吨。使用投入产出法计算核定的进项税额。

  当期允许抵扣农产品增值税进项税额=当期农产品耗用数量×农产品平均购买单价×扣除率/（1＋扣除率）=10000吨×1.06×0.4×9%/（1＋9%）=350.09万元。

  【提示】如果此例换成生产出的产品是酸奶等13%税率的货物，则公式中的扣除率为13%。

  依据：财税〔2012〕38号、财政部 税务总局 海关总署公告2019年第39号

  当期允许抵扣农产品增值税进项税额=当期主营业务成本×农产品耗用率×扣除率/（1＋扣除率）

  农产品外购金额（含税）不包括不构成货物实体的农产品（包括包装物、辅助材料、燃料、低值易耗品等）和在购进农产品之外单独支付的运费、入库前的整理费用。

  案例二：某酒厂（一般纳税人）外购粮食生产销售白酒，采用成本法核定增值税进项税额。经税务机关核定的粮食耗用率为80%。2019年6月，企业主营业务成本为150万元。假设不考虑别的副产品。

  解：当期允许抵扣粮食增值税进项税额=当期主营业务成本×农产品耗用率×扣除率/（1＋扣除率）=150*0.8*0.13/1.13=13.81万元

  由于《财政部 国家税务总局关于在部分行业试行农产品增值税进项税额核定扣除办法的通知》（财税〔2012〕38号）规定了试点纳税人购进农产品无论是不是用于试点行业生产产品，增值税进项税额均按照《农产品增值税进项税额核定扣除试点实施办法》（以下简称《实施办法》）的规定抵扣，因此试点纳税人购进农产品生产销售别的产品的，可采取《实施办法》第四条中“参照法”，即参照所属行业或者生产结构相近的其他试点纳税人，确定农产品单耗数量，并在投产当期增值税纳税申报时向主管税务局提出申请。

  当期允许抵扣农产品增值税进项税额=当期销售农产品数量/（1－损耗率）×农产品平均购买单价×9%/（1＋9％），

  比如2018年5月1日起，纳入试点的中药材商品交易中心按照该项规定，核定农产品增值税进项税额，不再凭增值税扣税凭证抵扣增值税进项税额。

  案例三：甲企业为增值税一般纳税人，属于农产品增值税进项税额核定扣除试点范围企业。2019年8月期初库存农产品200吨，期初平均买价0.21万元/吨；当月从农民手中购入农产品400吨，每吨含税价格0.24万元，入库前发生整理费用1万元；因企业生产能力下降，当月直接销售外购农产品260吨，取得不含税销售额140万元。

  （三）购进农产品用来生产经营且不构成货物实体的（包括包装物、辅助材料、燃料、低值易耗品等）

  当期允许抵扣农产品增值税进项税额=当期耗用农产品数量×农产品平均购买单价×（10%或9%）/（1+10%或9%)

  注：购进用来生产销售或委托加工13%税率货物的，扣除率为10%；用来生产销售或委托加工初级农产品的，扣除率为9%。

  例：某植物油厂购入原木生产用于本厂机械设备（适用税率13％）的包装箱，2020年2月份耗用原木10立方米，平均购买单价7800元立方米，计算原木进项税额。

  解：纳税人购进用来生产或委托加工13%税率货物的农产品，按照10%的扣除率计算进项税额。当期允许抵扣农产品増值税进项税额＝当期耗用农产品数量×农产品平均购买单价x10％／（1＋10％）＝10x7800x10％÷（1＋10％）＝7090元。

  案例四：M公司开具农产品收购凭证购进原乳1000万元，采用核定扣除办法。

  案例五：某纺织厂系增值税一般纳税人，以外购皮棉为原料生产棉纱，2019年5月8日，自某商贸小规模纳税人处收购皮棉200吨，取得对方代开的增值税专用发票1张，金额80万元，税额2.4万元，款项尚未支付。该企业棉纱无期初库存，当月对外直接销售皮棉90吨，每吨含税售价4400元，假定当地税务机关核定的损耗率为5%。

  当期允许抵扣农产品增值税进项税额=当期销售农产品数量/（1－损耗率）×农产品平均购买单价×9%/（1＋9％），

  （一）农产品核定扣除纳税人取得已证实虚开的农产品发票核定扣除，现金交易，无物流信息，过磅单，是不是能够补征增值税？

  个人理解：农产品收购发票虚开只能证明发票开具不合规，不能直接证明对外销售的业务不真实。核定扣除的目的是隔离虚开的进项税额，按销售数据反推进项税额。因此，虚开的进项税额不会造成核定扣除企业少交税后果。缺少物流信息或过磅单只能作为存在虚开可能性的间接证据。如果出售的收益是真实的，企业有可能从其他渠道获取原材料，只要能证明业务的真实性，企业就可根据《农产品增值税进项税额核定扣除试点实施办法》进行扣除。但存在为自己虚开发票被处罚的风险。

  虽然补缴税款与增值税进项税额无直接关系，但与企业所得税有关。根据《企业所得税税前扣除凭证管理办法》（国家税务总局公告2018年第28号）第十二条、第十三条、第十四条规定，企业取得虚开的发票，不得作为税前扣除凭证。若支出真实且已实际发生，应当在当年度汇算清缴期结束前，要求对方补开、换开发票、其他外部凭证。

  汇算清缴期结束后，税务机关发现企业应当取得而未取得发票、其他外部凭证或者取得不合规发票、不合规其他外部凭证并且告知企业的，企业应当自被告知之日起60日内补开、换开符合相关规定的发票、其他外部凭证。其中，因对方特殊原因无法补开、换开发票、其他外部凭证的，企业应当依规定，自被告知之日起60日内提供可以证实其支出真实性的相关资料。

  补开、换开后的发票、其他外部凭证符合相关规定的，可当作税前扣除凭证。企业在补开、换开发票、其他外部凭证过程中，因对方注销、撤销、依法被吊销营业执照、被税务机关认定为非正常户等特殊原因无法补开、换开发票、其他外部凭证的，可凭以下资料证实支出真实性后，其支出允许税前扣除：（一）无法补开、换开发票、其他外部凭证原因的证明资料（包括工商注销、机构撤销、列入非正常经营户、破产公告等证明资料）；（二）相关业务活动的合同或者协议；（三）采用非现金方式支付的付款凭证；（四）货物运输的证明资料；（五）货物入库、出库内部凭证；（六）企业会计核算记录以及别的资料。其中第一项至第三项为必备资料。企业在规定的期限未能补开、换开符合相关规定的发票、其他外部凭证，并且未能依规定提供有关的资料证实其支出真实性的，相应支出不得在发生年度税前扣除。

  （二）不符合试点范围的增值税一般纳税人购进农产品增值税进项税额，实施核定扣除办法，造成多抵扣进项税额。

  （三）购进农产品取得增值税专用发票，按核定扣除计算进项税额，同时勾选确认，造成重复抵扣农产品进项税额。